Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC93Q567U6 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms