Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ALFQ53S48 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms