Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PCK2Q16822 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PCK2Q16822 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PCK2Q16822 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PCK2Q16822 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PCK2Q16822 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PCK2Q16822 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PCK2Q16822 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PCK2Q16822 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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