Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIST3H3Q16695 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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