Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK5Q16478 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms