Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CNGA3Q16281 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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CNGA3Q16281 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CNGA3Q16281 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CNGA3Q16281 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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CNGA3Q16281 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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