Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATP6AP1Q15904 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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