Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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NEDD8Q15843 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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NEDD8Q15843 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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NEDD8Q15843 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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NEDD8Q15843 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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NEDD8Q15843 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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NEDD8Q15843 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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NEDD8Q15843 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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NEDD8Q15843 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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