Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDK5R1Q15078 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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