Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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