Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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GTF2H3Q13889 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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