Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA5AQ13591 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA5AQ13591 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms