Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEUROD1Q13562 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms