Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms