Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AP3B2Q13367 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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