Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms