Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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