Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9AP51151 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms