Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms