Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms