Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRB2P47870 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms