Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACADSBP45954 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms