Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CXCL5P42830 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CXCL5P42830 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CXCL5P42830 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CXCL5P42830 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CXCL5P42830 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CXCL5P42830 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CXCL5P42830 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CXCL5P42830 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CXCL5P42830 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CXCL5P42830 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CXCL5P42830 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CXCL5P42830 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
CXCL5P42830 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CXCL5P42830 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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