Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
APOBEC1P41238 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms