Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MLH1P40692 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MLH1P40692 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MLH1P40692 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms