Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms