Protein–RNA interactions for Protein: P37023

ACVRL1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVRL1P37023 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACVRL1P37023 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACVRL1P37023 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACVRL1P37023 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms