Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT1P21579 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT1P21579 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT1P21579 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT1P21579 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT1P21579 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT1P21579 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT1P21579 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT1P21579 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT1P21579 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT1P21579 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYT1P21579 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT1P21579 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT1P21579 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT1P21579 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT1P21579 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT1P21579 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT1P21579 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT1P21579 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYT1P21579 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms