Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRHP20396 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRHP20396 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRHP20396 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRHP20396 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRHP20396 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms