Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP2B1P20020 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms