Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD58P19256 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD58P19256 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD58P19256 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD58P19256 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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