Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms