Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYN1P17600 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYN1P17600 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYN1P17600 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms