Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPB42P16452 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPB42P16452 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPB42P16452 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EPB42P16452 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPB42P16452 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPB42P16452 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPB42P16452 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EPB42P16452 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EPB42P16452 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPB42P16452 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPB42P16452 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPB42P16452 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPB42P16452 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPB42P16452 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EPB42P16452 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPB42P16452 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPB42P16452 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPB42P16452 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPB42P16452 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EPB42P16452 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms