Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPCAMP16422 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms