Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTLA4P16410 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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