Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRF1P14222 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRF1P14222 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRF1P14222 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRF1P14222 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRF1P14222 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRF1P14222 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PRF1P14222 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms