Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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