Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F9P00740 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F9P00740 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms