Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TO15178 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TO15178 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TO15178 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TO15178 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TO15178 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TO15178 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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