Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms