Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms