Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP4E1Q9UPM8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms