Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNA3Q9UI47 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms