Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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COPS7AQ9UBW8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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