Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F12Q9HCS2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms