Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VAT1LQ9HCJ6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1LQ9HCJ6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms