Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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