Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms