Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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